上海复旦复华科技股份有限公司是复旦大学控股的上市公司，其前身为1984年创办的复旦大学科技开发公司。1986年，复旦大学科技开发总公司注册成立。1992年6月，公司改制为上海复华实业股份有限公司，成为全国高校第一家上市公司(证券代码：600624)。1993年1月，公司股票在上海证券交易所正式挂牌交易。2001年6月，公司更名为上海复旦复华科技股份有限公司。
依托复旦大学雄厚的科研、技术、人才优势，历经初创拓展、改制上市、调整转型、全面发展，复旦复华在“发展高科技、实现产业化”的探索与实践中，成功确立了以软件开发、生物医药、园区房产为核心的科技产业体系，目前已拥有中国重要的对日软件出口平台，具有科技创新能力的药品研发、生产、营销基地，以及广纳国内外高新技术企业的国家级高新技术园区。
2012年4月20日，上海食品药品监督管理局公布了本市明胶空心胶囊抽检结果，在这批公示的黑名单中，复旦复华科技股份有限公司控股子公司上海复旦复华药业有限公司位列于榜单之上。2012年04月24日，复旦复华对“问题胶囊”事件进行说明。公司除了承认控股子公司从浙江康诺购入的明胶空心胶囊中有一件样品铬含量超标外，还表示已对使用该批空心胶囊的16448盒石杉碱甲胶囊进行召回。
公司于2024年3月18日收到上海证监局下发的《关于对上海复旦复华科技股份有限公司采取责令改正措施的决定》。经查，复旦复华存在以下违规行为：2013年~2017年间，公司为解决参股公司上海高新房地产发展有限公司和上海复华中日医疗健康产业发展有限公司对公司的历史宕账，账外累计向公司建筑承包商舜杰建设（集团）有限公司借款7500万元，虚假平账，其中2000万元债务于2023年11月已被生效司法裁判文书确认，5500万元处于诉讼程序。2023年6月，公司根据一审判决书，计提2000万元预计负债，全额确认为当期损失。上海证监局指出，公司上述隐瞒负债、虚假平账、不当会计确认等行为，导致公司披露的2013年~2023年期间的定期财务报告存在虚假记载。上海证监局决定对复旦复华采取责令改正的监督管理措施。公司应强化依法合规意识，切实做好信息披露工作。
2024年8月5日，复旦复华(600624)公告，公司8月5日收到中国证监会《立案告知书》。因公司涉嫌信息披露违法违规，中国证监会决定对公司立案。2025年9月19日晚，复旦复华公告称，当日，公司收到上海证监局出具的《行政处罚事先告知书》，因公司2019年、2020年及2023年年度报告存在虚假记载，上海证监局拟对公司给予警告，并处以400万元罚款，并拟对其他当事人处以不同程度处罚。公司同日发布关于实施其他风险警示暨停牌的公告。