DNA搜索引擎MetaGraph研发成功

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Meta(META)
   

瑞士苏黎世联邦理工学院科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称,他们开发出一款名为MetaGraph的DNA搜索引擎,能快速、高效地检索公共生物学数据库中的海量信息,为研究生命科学提供了强大的专业工具。

MetaGraph的研发,源于科学界对日益庞大的基因测序数据“用不好、找不着”的现实困境。过去几十年来,各类生物学数据库规模呈爆炸式增长,然而原始测序数据往往碎片化、噪声多、体量庞大,科学家难以直接从中高效提取有用信息。

MetaGraph的核心突破在于采用数学中的“图结构”,将相互重叠的DNA片段智能联结。其原理类似于图书索引中将含有相同关键词的句子关联起来,形成知识网络。研究团队整合了7个公共资助数据库,构建出一个跨越病毒、细菌、真菌、植物、动物乃至人类的生命全谱系索引。该索引共涵盖1880万个独特的DNA与RNA序列集,以及2100亿个氨基酸序列集。

基于这一庞大索引,团队开发出了

来源:东方财富网

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