AI秒级锁定致病变异!迪安诊断“基因领航”一体机装上智能引擎,大幅提高临床解读效率

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迪安诊断(SZ300244)
   

作为高通量测序技术的重要代表,全外显子组测序(WES)、全基因组测序(WGS)会产生海量的基因数据,并广泛应用于疾病诊断、遗传病筛查、用药指导等领域。以WES为例,通常情况下,一次检测可能会产生出80000条变异结果,但大部分是干扰信息。传统的生物信息学分析能把结果缩小到近800条的范围内,但仍然需要大量的筛选工作。如何又快又准地筛选出与患者病情直接相关的致病变异,成为临床开展精准诊疗的关键。

针对这一需求,迪安诊断(300244)“基因领航”生物信息分析一体机,安装上了PhenoCompass表型罗盘这个“智慧导航仪”。只需输入患者的病史等临床描述信息,系统便会将其秒级转化为标准HPO(人类表型数据库)术语,并按照“表型-基因”匹配度给所有相关基因进行排序,把候选变异的数量从三位数聚拢至个位数,让致病变异“自动浮出水面”,大幅提高了临床解读效率。

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PhenoCompass表型罗盘是“基因领航”一体机的两大智能引擎之一,具备表型识别与标准化、疾病基因分析等核心功能。下面,我们来看看PhenoCompass表型罗盘是如何定位致病变异的——

第一步

输入临床描述,AI识别表型

登录系统后,在输入框内输入临床信息文本(例如临床诊断血钾浓度2.3),点击“AI识别表型”按钮,就可以用内置的DeepSeek自动匹配临床表型和疾病名称,得到相应的词条(如下图中的血钾浓度、低钾血症)。

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第二步

表型标准化

点击“表型标准化”按钮,即可把AI提供的词条转化为标准的HPO术语或者疾病名称,以便精准匹配数据库中的疾病和表型信息。

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第三步

疾病基因分析

点击“疾病基因分析”按钮,系统便开始自动匹配,输出可能的疾病以及需要重点关注的基因信息,并按照可能性的高低进行排序展示。用户还能下载疾病和基因信息,查看详情。如果您有相关生信分析经验,可以将该结果用于生信分析流程变异过滤或者变异排序,可大大提高工作效率。

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选用300例WES阳性数据对PhenoCompass表型罗盘的模型进行训练,选用154例WES阳性数据用于验证,通过对比发现,PhenoCompass的排序结果较为优异,53.9%的阳性变异都排在其输出结果的Top 5之内。

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A:PhenoCompass疾病打分模型测试、验证数据集分布。B:模型参数调试流程图。C:验证数据集分析示意图。D:验证数据集阳性变异排序占比分布图。

体验方式

首先,发送邮件至ngs-bioinfo@dazd.cn申请体验。(邮件标题为“表型罗盘试用申请”,邮件内容需注明您的姓名、手机号码、工作单位及职务。请注意,手机号码将作为您的登录账号,请务必填写正确。)

通过申请后,手机或电脑访问官网https://phenocompass.dazd.cn/即可体验。

来源:同花顺财经

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