新疆塔里木农业综合开发股份有限公司的主营业务是乳制品加工及销售、种子及其副产品加工及销售以及甘草深加工产品的加工及销售。公司的主要产品是皮棉、短绒、粮种、棉种、棉籽、苗木、其他-毛粮、液态奶、全脂淡奶粉、鲜奶（牛）、甘草制品、育肥牛。